La biodiversidad del Área Marino Costera Protegida de Múltiples Usos Fiordo Comau está disminuyendo, según monitoreos científicos de 2023 y 2024. El oxígeno también está decayendo. Los impactos se deberían a la presencia de la industria salmonera. Su alta biodiversidad y el bajo intercambio de agua con el océano convierten al fiordo en un lugar sensible a la contaminación. Científicos, líderes indígenas y de organizaciones sociales plantean la necesidad de que la salmonicultura salga de las áreas protegidas.

Por 29 votos en contra, 2 a favor, 2 a favor con modificaciones y 1 abstención la Comisión Regional de Uso de Borde Costero (CRUBC) de Aysén rechazó dos solicitudes que las comunidades Pu Wapi y Antünen Rain ingresaron en 2016 y 2017 para la creación de Espacios Marítimos Costeros para Pueblos Originarios (ECMPO) una superficie de 621 mil hectáreas de borde costero.